原本的历史上，吴中行与赵用贤将会受到廷杖，其中吴中行因伤势过重被截肢，赵用贤被流放，而沈懋学因为立场不坚定，临阵退缩，与张居正之子攀上关系，而免遭刑罚。
如今，明朝源远流长的光荣传统——廷杖，早在万历三年就明文取消了，所以这几个人的处罚结果，实际上是要轻很多的。
对于廷杖，明朝官员不仅不痛恨，相反还趋之若鹜，因为谁受了廷杖，那就意味着你仗义执言，敢于得罪皇帝，立马名扬天下，哪怕被廷杖死了，也能在史书上留下光辉的一笔，何其幸哉！
这些人并不知道历史已经偏离了原来的轨道，所以廷杖虽然取消，但这个处理结果，显然无法让所有人满意。——张居正觉得太便宜他们了，而更多的人认为张居正这是太过霸道，以致于连他的学生都背叛了他。
一方面是首辅的不满，另一方面是都察院那帮言官群情激涌，喊着要为同僚伸冤，换了隆庆帝在位，定会惊慌失措，犹豫不决，能拖就拖，但落在朱翊钧手上，他却采取了截然不同，让众人都大出意料的方式，不退反进。
万历五年十二月，皇帝亲自起草言事十法，改革都察院。
在那之前，都察院的主要职责是“纠劾百司，辩明冤枉，提督各道，为天子耳目风纪之司”。说白了，就是百官里面，看谁不顺眼，就可以弹劾谁。有人的地方就会有江湖，而人心都是肉长的，所以纵然御史选拔再严格，也逃脱不了御史变成党争的工具，今天关心皇帝私生活，明天怀疑哪个武将有造反的野心，建设性谈不上，但破坏力往往是强大的。
有鉴于此，朱翊钧明确提出一个概念，非证据确凿不可纠劾，并且将都察院的工作内容分成两大块，其中最重要的一块，就是反贪。
明朝官场贪污成风，要反贪，得先立法，过分严厉不行，太放纵也不可，而且，官员俸禄本身就很低，这就连带着要改革官员俸禄制度，现在国库收入增加了，要增加俸禄倒也不难，这是反贪的一个基本前提，否则你不让他们贪，他们连基本生活都没法维持。
为此，朱翊钧制定了一个详细的规则，除了提高官员薪俸福利之外，又接受赵肃的建议，规详细划定受贿行贿，挪用公款，巨额财产来源不明等具体标准，反贪的对象，不仅是官员，还包括官员九族之内的亲眷。
其次则是纠正官员作风，这也划定了明确的范围，而非像以往那样捕风捉影，信口开河，包括违反大明律者，苛待百姓者，冒用政绩者等等，都作了具体的分类规定。
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